西元2199年，来自太阳系外的敌人加米拉斯帝国，为了挽救母(mǔ )星(🥈)的危亡，开始侵略其他星球。地球(👋)军在与加米(🌗)拉斯帝国军的交战中(zhōng )惨败，同时加米拉斯帝国军向地球发射(🚉)大量含(hán )有放射能的游星炸弹。地球的抵抗力量越来越弱。本与加(⏺)米拉斯为双子星球的伊斯坎达尔星球仗义相(🌑)助，向地球发送了波动引擎和波动炮(🤸)的设计图纸，并告知地球军本星球拥(yōng )有清除放射能的设(shè )备“宇宙清洗器D”。在与欧(⚾)洲、美洲失去(🈁)联系的情况下，地(dì )(👊)球防(fáng )卫军利用伊斯坎达(🐛)尔星球(🐨)提供(gòng )的技术将沉睡于海底的大和号改造为宇宙战舰。大和号全体乘员踏上了取回“宇宙清(qīng )洗器D”的漫漫征程。